A Secretaria de Controle Interno foi criada com o objetivo de assistir o Poder Executivo em asuntos que sejam relativos à legalidade dos processos que tramitam na Prefeitura de Sousa, sejam eles licitações, convênios e contratos diversos. Além disso, atua na defesa do patrimônio público, na coordenação do Portal da Transparência, assim como em auditorias e prevenção e combate à corrupção.
